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樣品要求及注意事項(xiàng)
1. 樣品要求
不同來源的環(huán)境樣品中含有的DNA量差異很大，用于DNA提取時(shí)所需質(zhì)量有所差異。環(huán)境樣品一般存儲(chǔ)于無菌的10-50 ml的離心管中。如果是提取的DNA樣品，一般存儲(chǔ)于無菌的1.5 ml離心管中。
| 環(huán)境樣品（用于基因組DNA提取） | DNA |
| 土壤：5-10 g; | 微生物群落分析：請(qǐng)將提取的DNA稀釋成濃度為10ng/ml,提供體積大于20ml的DNA溶液。OD260/280介于1.8-2.0之間，并確保DNA無降解 |
| 底泥：5-10 g; | 宏基因組分析：提供濃度大于50ng/ml,體積大于60 ml的DNA，并確保DNA無降解 |
| 水體：1-3 L水樣用0.22 mm濾膜過濾后的濾膜 | 宏轉(zhuǎn)錄組分析：提供濃度大于50ng/ml,體積大于80 ml的DNA，并確保RNA無降解 |
| 糞便：1-5g; | |
| 腸道內(nèi)容物：2-5 g; | |
| 粘膜：指甲大小或更多 | |
| 植物內(nèi)生菌：15-30g葉片；3-10g根系； | |
| 血液：10ml | |
| 葉片：50-100g |
2. 樣品保存及郵寄的注意事項(xiàng)
請(qǐng)將制備好的DNA或者RNA樣品保存在TE buffer 或超純水中，置于1.5 ml離心管中。用封口膜封好，并用記號(hào)筆或標(biāo)簽清晰、準(zhǔn)確地標(biāo)記樣品編號(hào)、日期、姓名。如需長(zhǎng)期保存，請(qǐng)置于-80℃低溫冷凍箱內(nèi)。但為防止樣品降解對(duì)測(cè)序的影響，我們接受的DNA 樣品凍存時(shí)間不超過三個(gè)月，RNA樣品凍存時(shí)間不超過一個(gè)月。運(yùn)輸中請(qǐng)使用足量的干冰，以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。郵寄樣品時(shí)請(qǐng)將1.5 ml 離心管放置于50 ml 的大離心管中，以防運(yùn)輸過程中碰撞彈開蓋子。
請(qǐng)您對(duì)遞交的每一份樣品在您實(shí)驗(yàn)室留有足量的備份。深度測(cè)序技術(shù)流程復(fù)雜，在建立測(cè)序文庫(kù)及上機(jī)測(cè)序過程中可能因不可控因素而出現(xiàn)失敗導(dǎo)致樣品損失，所以請(qǐng)確保測(cè)序失敗后仍有足夠量樣品做再次測(cè)序。
